实验室应设置门禁系统，避免无授权人员随意进入实验室区域。实验室应防火，对于有危险物品的实验室，电线、照明、插座等都要按防爆设计，实验室设计应符合消防规范。明确微生物实验室检测菌体以及检测标准和方法才能进行下一步的实验室设计与规划。菌体的不同，决定微生物实验室洁净度等级的不同。灭菌室主要用于培养基的灭菌和各种器具的灭菌，室内应备有高压蒸汽灭菌器、烘箱等灭菌设备及设施。
用于检测和/或校准的实验室设施，包括但不限于能源、照明和环境条件，应有利于检测和/或校准的正确实施。实验室建设应确保其环境条件不会使结果无效，或对所要求的测量质量产生不良影响。实验室装修施工的基本要求，建设一座功能完善的实验室，要由专业技术人员进行专业的实验室设计，要综合考虑， 遵循以人为本的原则，建成正规化、标准化的实验室达到使用效果。
一级生物安全防护实验室，实验室结构和设施、安全操作规程、安全设备适用于对健康成年人已知无致病作用的微生物，如用于教学的普通微生物实验室等。微生物实验室应选择在清洁安静的场所，远离生活区，锅炉与交通要道，微生物实验室应选择在光线充足，通风良好的场所，要与实验室其他区域，如饮水间、卫生间等区域有一定的距离。
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